ในด้านผู้บริหารมหาวิทยาลัยนั้น ตั้งแต่เริ่มมีพระราชบัญญัติมหาวิทยาลัยมาเมื่อปี พ.ศ. 2511 จนถึงปัจจุบัน มีคณะผู้บริหารซึ่งมีอธิการบดีเป็นหัวหน้า ทำการบริหารมหาวิทยาลัยมาแล้ว 15 สมัย ดังนี้

สมัยที่ 1	เม.ย. 2511 - มี.ค. 2512	ฯพณฯ พ.อ.(พิเศษ) ถนัด คอมันตร์
สมัยที่ 2	มี.ค. 2512 – ก.ค. 2514	ศ.ดร.สตางค์ มงคลสุข
สมัยที่ 3	ก.ค. 2514 – ก.ค. 2516	ศ.ดร.บัวเรศ คำทอง
สมัยที่ 4	ก.ค. 2516 – ก.ค. 2518	ศ.นพ.สวัสดิ์ สกุลไทย
สมัยที่ 5 และ 6	ก.ค. 2518 – ก.ค. 2522	ผศ.ดร.ผาสุข กลุละวณิชย์
สมัยที่ 7 และ 8	ก.ค. 2522 - มิ.ย. 2528	รศ.นพ.ทองจันทร์ หงศ์ลดารมภ์
สมัยที่ 9 และ 10	ก.ค. 2528 – พ.ค. 2534	ผศ.ดร.ผาสุข กลุละวณิชย์
สมัยที่ 11 และ 12	มิ.ย. 2534 – พ.ค. 2540	รศ.ดร.ศิริพงษ์ ศรีพิพัฒน์
สมัยที่ 13	มิ.ย. 2540 – พ.ค. 2543	ผศ.ดร.สุนทร โสตถิพันธุ์
สมัยที่ 14 และ 15	มิ.ย. 2543 – มี.ค. 2549	รศ.ดร.ประเสริฐ ชิตพงศ์
สมัยที่ 16	พ.ค. 2549 – ปัจจุบัน	รศ.ดร.บุญสม ศิริบำรุงสุข